Für Suchmaschinen sind beide Varianten egal, wenn sie denn irgendwo verlinkt sind.

Dennoch ist Variante 1 vorzugswürdig.

- Wordpress ist kostenlos und Webspace mit PHP + Datenbank auch fast geschenkt.
- Wenn du dein Blog als Unterverzeichnis deiner Site integrierst, fütterst du deine Website mit Content und nicht fremde Bloghoster (die teilweise auch Backlinks im Footer zu anderen Portalen einbauen).
- Wenn deine Blog-Posts gut sind, und von anderen Bloggern aufgegriffen und verlinkt werden, profitiert nicht nur dein Blog, sondern auch deine ganze Website von den freiwilligen Backlinks.
- Du musst nur eine Website promoten, also in Webkataloge eintragen etc., wenn du das Blog als Unterverzeichnis einrichtest.

Natürlich können auch andere Gründe (Thema, Kommunikationsziel, etc.) dafür sprechen, das Blog extern einzurichten, da muss man halt abwägen.

HTH :-)